More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2639 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
391 aa  817    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  64.34 
 
 
388 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  63.87 
 
 
390 aa  534  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  60.26 
 
 
393 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  58.46 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2612  Cystathionine gamma-synthase  57.14 
 
 
395 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.34 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.74 
 
 
403 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.74 
 
 
403 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.13 
 
 
404 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.13 
 
 
404 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
403 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
403 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 
393 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.69 
 
 
389 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.48 
 
 
403 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 
403 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
403 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 
403 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.49 
 
 
397 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.74 
 
 
403 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.39 
 
 
397 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 
397 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.05 
 
 
395 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.02 
 
 
394 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.78 
 
 
393 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
394 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
403 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.44 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.93 
 
 
396 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.37 
 
 
402 aa  355  8.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  45.31 
 
 
396 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.88 
 
 
406 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.94 
 
 
399 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.31 
 
 
391 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 
412 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
402 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.86 
 
 
411 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 
412 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 
412 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
396 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
411 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 
392 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.07 
 
 
402 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.65 
 
 
383 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.76 
 
 
407 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 
405 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.27 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.27 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.27 
 
 
396 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.43 
 
 
411 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.68 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.76 
 
 
423 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 
397 aa  342  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.76 
 
 
423 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.76 
 
 
396 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.24 
 
 
423 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.24 
 
 
405 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.24 
 
 
423 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.24 
 
 
407 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.76 
 
 
396 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.58 
 
 
394 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.53 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.73 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.75 
 
 
402 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.22 
 
 
402 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.47 
 
 
396 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.27 
 
 
402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.13 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.76 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.55 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.24 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.49 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  43.42 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.35 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.85 
 
 
419 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
406 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.59 
 
 
417 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.86 
 
 
396 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.56 
 
 
407 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.75 
 
 
401 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.49 
 
 
408 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.88 
 
 
410 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  41.73 
 
 
393 aa  332  5e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.27 
 
 
404 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
402 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.15 
 
 
404 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 
401 aa  329  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.05 
 
 
408 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.79 
 
 
404 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
408 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.82 
 
 
397 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  42.93 
 
 
399 aa  328  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>