More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1562 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.37 
 
 		 403 aa  700    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.78 
 
 		 403 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.09 
 
 		 403 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.09 
 
 		 403 aa  742    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  96.28 
 
 		 403 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.84 
 
 		 403 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  96.03 
 
 		 403 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  82.63 
 
 		 403 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  80.4 
 
 		 403 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 		 403 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  81.64 
 
 		 403 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  69.67 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.76 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.54 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.7 
 
 		 392 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.09 
 
 		 383 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.16 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.73 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.1 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.72 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.44 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.1 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.67 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.11 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.66 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.66 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  55.64 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.16 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.15 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.32 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.77 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.1 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.57 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.52 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.63 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.75 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.84 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.52 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.75 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.38 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.82 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.02 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.95 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.71 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.84 
 
 		 410 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.92 
 
 		 411 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.56 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.56 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.47 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.47 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.45 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.47 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.65 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.51 
 
 		 402 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1998  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.62 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.469724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.35 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 452 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  48.04 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.82 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  49.23 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  56.35 
 
 		 414 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  48.96 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.41 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.73 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.73 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.73 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.96 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.44 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.91 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.37 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.51 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.36 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.55 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 		 412 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.17 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.32 
 
 		 412 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.32 
 
 		 412 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.97 
 
 		 411 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.61 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.84 
 
 		 410 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.26 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.99 
 
 		 404 aa  358  8e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 		 422 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.91 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  46.98 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  45.08 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.51 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.57 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.91 
 
 		 408 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>