More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4768 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 		 452 aa  925    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  84.37 
 
 		 404 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.87 
 
 		 404 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  74.25 
 
 		 411 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  71.25 
 
 		 411 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.74 
 
 		 404 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.49 
 
 		 407 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.41 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  70.6 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.81 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.06 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.18 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.2 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.21 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.84 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.2 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.21 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.7 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.06 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.06 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.06 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.47 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.56 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.82 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.98 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.68 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.68 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.22 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.57 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.21 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.21 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.7 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.7 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.3 
 
 		 392 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.8 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.35 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.11 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.73 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.31 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.12 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.82 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.91 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.44 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.03 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.44 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.3 
 
 		 403 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.51 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.29 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.05 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.16 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.82 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.21 
 
 		 402 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.35 
 
 		 397 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.17 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.44 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.15 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.51 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.25 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.87 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.13 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.02 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  48.33 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.61 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.57 
 
 		 406 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  45.73 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  45.63 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.08 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.24 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.76 
 
 		 397 aa  353  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 		 403 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.32 
 
 		 410 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.17 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.36 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.16 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  47.38 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.25 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.3 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.09 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  44.07 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  46.5 
 
 		 401 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.56 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.92 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.45 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.72 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.22 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.22 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.32 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.89 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.05 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 		 397 aa  332  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.12 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>