More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3649 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 418 aa  855    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  66.93 
 
 		 398 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  66.93 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  65.89 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  65.37 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  64.14 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  63.5 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  61.27 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  57.11 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  54.73 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  55.19 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  55.27 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  47.03 
 
 		 394 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  46.23 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  46.02 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  45.13 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  48.57 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.62 
 
 		 379 aa  362  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  44.62 
 
 		 392 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  43.67 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  48.05 
 
 		 397 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 391 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 391 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  44.62 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  44.62 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  46.89 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 		 391 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  48.36 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  45.74 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.05 
 
 		 397 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  46.77 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  43.78 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.81 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  45.34 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.76 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  44.05 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  44.67 
 
 		 398 aa  325  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.12 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.3 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.71 
 
 		 427 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.61 
 
 		 426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.75 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1497  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.38 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.22 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.37 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  41.56 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  44.07 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  41.09 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.7 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.1 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.82 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  43.96 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.28 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.28 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.21 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  44.07 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  45.64 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.21 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  43.26 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.59 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0970  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.58 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111967  normal  0.585496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.49 
 
 		 378 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.33 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1846  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.33 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.455791  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 390 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 386 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.46 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.75 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1876  cystathionine gamma-synthase  46.52 
 
 		 341 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.562366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.77 
 
 		 390 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  43.93 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1183  O-acetyl-L-homoserine sulfhydrylase  39.38 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.52 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4968  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.14 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>