More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0317 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  99.22 
 
 
386 aa  777    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  98.45 
 
 
386 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  95.05 
 
 
386 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  100 
 
 
386 aa  783    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  51.31 
 
 
401 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
390 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  45.71 
 
 
390 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  44.82 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  43.9 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 
397 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  45.69 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  45.95 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  45.1 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  45.69 
 
 
397 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.55 
 
 
390 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  45.81 
 
 
397 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
392 aa  332  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
400 aa  328  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.24 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  45.17 
 
 
397 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  44.7 
 
 
399 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.05 
 
 
397 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  44.56 
 
 
396 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  46.44 
 
 
394 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  44.99 
 
 
397 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  45.19 
 
 
398 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  44.94 
 
 
398 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  45.52 
 
 
392 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  44.42 
 
 
398 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  44.42 
 
 
397 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  43.41 
 
 
392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  42.16 
 
 
401 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  43.41 
 
 
392 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  44.56 
 
 
391 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  44.13 
 
 
392 aa  315  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 
392 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  41.45 
 
 
393 aa  312  7.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 
392 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 
418 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  41.28 
 
 
394 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  43.08 
 
 
413 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.15 
 
 
407 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  44.16 
 
 
394 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.04 
 
 
392 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  42.12 
 
 
396 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.6 
 
 
377 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.86 
 
 
383 aa  292  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.64 
 
 
378 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 
380 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 
377 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 
377 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.83 
 
 
378 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  41.97 
 
 
380 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 
379 aa  290  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 
377 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 
377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.12 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.06 
 
 
397 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  41.54 
 
 
380 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  42.16 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 
394 aa  285  7e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.7 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.83 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.93 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.16 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 
378 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 
426 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 
381 aa  281  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 
378 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 
392 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
426 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  40.62 
 
 
423 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  40.62 
 
 
423 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 
393 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 
381 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1330  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.05 
 
 
420 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000859457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  43.04 
 
 
377 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.21 
 
 
429 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.78 
 
 
377 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.49 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  40.1 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.19 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  40.57 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>