More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1401 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 392 aa  804    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  52.96 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  51.15 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  43.98 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  43.19 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.04 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  42.67 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  45.05 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  45.05 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  42.35 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  42.35 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  42.09 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.09 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  42.35 
 
 		 397 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 377 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  44.01 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  41.65 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  44.01 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  40.47 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  42.38 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.3 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  41.39 
 
 		 397 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42.05 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  42.12 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  42.42 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  41.62 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  42.41 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.87 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.41 
 
 		 393 aa  312  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  42.27 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  41.19 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.28 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  43.75 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.93 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  41.39 
 
 		 401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.56 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.97 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.31 
 
 		 400 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  40.31 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.93 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.45 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  42.19 
 
 		 378 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  40.93 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 		 377 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.2 
 
 		 389 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  40.73 
 
 		 379 aa  302  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 400 aa  302  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.89 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  42.71 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.15 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41.71 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  44.44 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  40.78 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.92 
 
 		 387 aa  298  9e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 387 aa  298  9e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.43 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.82 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  40.89 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  42.04 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  40.22 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.71 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  41.78 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  41.25 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  38.66 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.75 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  41.41 
 
 		 379 aa  294  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>