More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3333 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 393 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  64.32 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  57.81 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  57.81 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  43.51 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  44.32 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  41.9 
 
 		 386 aa  311  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  43.13 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  39.54 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  43.75 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.62 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.46 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.44 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.34 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.67 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 377 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.5 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 377 aa  295  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  40.65 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  40.65 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  40.65 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.63 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.25 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  42.16 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  41.46 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.08 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  42.19 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  39.08 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  40.7 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  41.82 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.39 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  42.66 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  40.7 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.1 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  42.67 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  40.81 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.51 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  38.34 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  41.08 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.08 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.86 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  40.26 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.27 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.28 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.73 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  40.83 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.69 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.95 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.43 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.92 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  40.65 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.12 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.15 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  38.97 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  40.62 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>