More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0673 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  759    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  71.47 
 
 		 376 aa  556  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.95 
 
 		 379 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  43.9 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  44.32 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.46 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  41.79 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 		 381 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 398 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  43.15 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1485  cystathionine gamma-synthase  43.9 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.923651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  40.68 
 
 		 426 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.76 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  42.66 
 
 		 393 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  42.12 
 
 		 390 aa  288  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.54 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  42.55 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  41.24 
 
 		 392 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.64 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  41.05 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  41.98 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.44 
 
 		 387 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.33 
 
 		 377 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.01 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.16 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 		 387 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 		 387 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  42.05 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  43.83 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  43.83 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.9 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.79 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  41.32 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.9 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.22 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.14 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.44 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  42.31 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0243  cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.814419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.82 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  40.43 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  41.46 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40.31 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 393 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.21 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.54 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  39.47 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.25 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  38.95 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1364  cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  41.8 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.32 
 
 		 377 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  40.71 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  40.71 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  40.71 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  40.38 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.54 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.76 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.44 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.05 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  42.66 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  40.48 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.96 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.44 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.35 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.25 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.95 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.34 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>