More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1948 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
398 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  58.52 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
392 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  48.85 
 
 
433 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  43.41 
 
 
397 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  43.41 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  44.13 
 
 
397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  43.93 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  43.01 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.33 
 
 
390 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  43.67 
 
 
397 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  43.67 
 
 
397 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.94 
 
 
386 aa  299  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  42.05 
 
 
377 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 
392 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
394 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 
377 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.38 
 
 
394 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  43.62 
 
 
390 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.62 
 
 
390 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.86 
 
 
393 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  43.59 
 
 
381 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  43.62 
 
 
390 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41.34 
 
 
378 aa  292  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 
386 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
376 aa  290  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.41 
 
 
388 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40 
 
 
377 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40 
 
 
377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 
394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 
394 aa  289  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  40 
 
 
377 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40.41 
 
 
380 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.62 
 
 
392 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 
383 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  44.1 
 
 
381 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  41.34 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.86 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 
377 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.82 
 
 
379 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 
378 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 
378 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  42.59 
 
 
374 aa  285  8e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.32 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  40.92 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  40.45 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  44.78 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.11 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  43.14 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  37.91 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.89 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  41.52 
 
 
391 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 
391 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  39.33 
 
 
379 aa  281  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.04 
 
 
401 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.14 
 
 
413 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 
392 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.74 
 
 
379 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 
426 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.25 
 
 
399 aa  278  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 
398 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  38.05 
 
 
393 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 
400 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  38.11 
 
 
380 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 
393 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.65 
 
 
387 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  43.51 
 
 
389 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 
393 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.82 
 
 
392 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 
389 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.05 
 
 
379 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
381 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.39 
 
 
387 aa  275  9e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.49 
 
 
398 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.59 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  41.07 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  38.79 
 
 
387 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
396 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.67 
 
 
392 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  41.62 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  37.56 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 
392 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.24 
 
 
398 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  41.84 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 
426 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 
389 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.22 
 
 
397 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  39.18 
 
 
380 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>