More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1897 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
393 aa  806    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.13 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 
378 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  41.15 
 
 
380 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
381 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 
383 aa  293  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 
399 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.78 
 
 
379 aa  292  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 
398 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  40.77 
 
 
395 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.36 
 
 
401 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  41.09 
 
 
393 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  41.43 
 
 
391 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  42.55 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.56 
 
 
386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  41.25 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 
392 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.19 
 
 
379 aa  285  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  41.07 
 
 
400 aa  285  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 
399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  41.81 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  42.56 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  41.01 
 
 
418 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 
380 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.12 
 
 
394 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 
392 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 
398 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 
377 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
377 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 
426 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 
393 aa  279  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 
393 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 
397 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.1 
 
 
402 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.89 
 
 
387 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.58 
 
 
394 aa  275  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  42.55 
 
 
394 aa  275  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 
379 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.9 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.17 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.64 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.42 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.49 
 
 
397 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.55 
 
 
394 aa  274  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.95 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  39.19 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.27 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  39.48 
 
 
392 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 
380 aa  273  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 
398 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.36 
 
 
391 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.45 
 
 
381 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 
380 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.6 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.48 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.97 
 
 
390 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 
394 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  40.78 
 
 
381 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.67 
 
 
385 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  39.43 
 
 
397 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.74 
 
 
422 aa  269  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  40.67 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  38.17 
 
 
376 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.7 
 
 
397 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  40.27 
 
 
374 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.76 
 
 
393 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.69 
 
 
377 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.43 
 
 
397 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.13 
 
 
426 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 
392 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  40.21 
 
 
382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.01 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.22 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.22 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  38.02 
 
 
423 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.11 
 
 
386 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 
388 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.69 
 
 
393 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  38.86 
 
 
393 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.82 
 
 
390 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.7 
 
 
397 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.21 
 
 
391 aa  265  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.23 
 
 
385 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>