More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4541 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  96.22 
 
 		 398 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  98.22 
 
 		 397 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 398 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  96.22 
 
 		 398 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  67.78 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  67.1 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  65.89 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  64.78 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  56.92 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  55.19 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  59.39 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  57.84 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  48.74 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  48.32 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  47.03 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  46.92 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  48.96 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  48.57 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  46.97 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  46.97 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  48.44 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  48.44 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.39 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  48.18 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  46.46 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  47.96 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  48.96 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  48.99 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  47.96 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  48.46 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  45.57 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.18 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  48.96 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  44.82 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  48.73 
 
 		 401 aa  358  9e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.04 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  46.02 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.23 
 
 		 394 aa  342  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.28 
 
 		 427 aa  338  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6240  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.97 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.27 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.97 
 
 		 378 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  46.82 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1758  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.25 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831826  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.37 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2339  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.55 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  42.03 
 
 		 388 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2040  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.31 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.11 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.86 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  43.04 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.57 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.28 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.18 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  46.68 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.18 
 
 		 426 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  39.57 
 
 		 434 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.99 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  43.62 
 
 		 383 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  44.87 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  44.42 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.14 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  45.6 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 		 400 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.42 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4276  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.65 
 
 		 423 aa  322  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  46.09 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0970  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.81 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111967  normal  0.585496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1056  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.33 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.13 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.69 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 		 381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  45.76 
 
 		 426 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.5 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.42 
 
 		 443 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.82 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.66 
 
 		 386 aa  318  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1497  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.53 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>