More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0771 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  100 
 
 
399 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  67.78 
 
 
398 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  67.53 
 
 
398 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  67.53 
 
 
398 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  67.36 
 
 
397 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  67.44 
 
 
396 aa  541  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  65.15 
 
 
400 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  64.14 
 
 
418 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  63.73 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  62.98 
 
 
399 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  56.89 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  55.38 
 
 
401 aa  463  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  48.6 
 
 
394 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  51.3 
 
 
413 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  48.47 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  47.93 
 
 
390 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  50.9 
 
 
397 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
397 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
397 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
397 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  50.65 
 
 
397 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  49.61 
 
 
397 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  50.78 
 
 
397 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 
391 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 
397 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 
397 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  48.59 
 
 
392 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  47.8 
 
 
391 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.08 
 
 
394 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
392 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
392 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
392 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
392 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 
407 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
391 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  45.88 
 
 
396 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  49.11 
 
 
394 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
392 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
391 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
392 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
391 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  46.77 
 
 
392 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 
392 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  48.5 
 
 
398 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43.99 
 
 
399 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 
390 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  47.57 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 
392 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  49.37 
 
 
401 aa  350  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.22 
 
 
397 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.88 
 
 
379 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  46.51 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  45.1 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.77 
 
 
393 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  45.22 
 
 
386 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.85 
 
 
386 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.88 
 
 
389 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.9 
 
 
388 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.37 
 
 
380 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.59 
 
 
434 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  44.59 
 
 
386 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.9 
 
 
390 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41 
 
 
427 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.32 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.26 
 
 
426 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.54 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4276  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.34 
 
 
423 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 
394 aa  325  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.32 
 
 
387 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 
390 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.03 
 
 
426 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  41.48 
 
 
388 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.22 
 
 
423 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.82 
 
 
387 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  43.96 
 
 
381 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.88 
 
 
390 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2851  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.79 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.45 
 
 
397 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.43 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1497  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.26 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
392 aa  319  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.72 
 
 
404 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  46.51 
 
 
390 aa  319  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.72 
 
 
404 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  39.49 
 
 
390 aa  319  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.53 
 
 
379 aa  318  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.58 
 
 
403 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1056  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.69 
 
 
422 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.47 
 
 
449 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1758  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.57 
 
 
428 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831826  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.73 
 
 
390 aa  316  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.16 
 
 
393 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1690  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.14 
 
 
427 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.04 
 
 
381 aa  316  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.96 
 
 
397 aa  315  6e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.34 
 
 
398 aa  316  6e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.99 
 
 
380 aa  315  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.84 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1146  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.43 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000163408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.53 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>