More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4283 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  97.43 
 
 		 389 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  97.69 
 
 		 389 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 389 aa  799    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  45.01 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43.66 
 
 		 399 aa  295  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.89 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.44 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.32 
 
 		 383 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.43 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.87 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.86 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.9 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.65 
 
 		 378 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  46.59 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 		 392 aa  289  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  39.94 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  43.7 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.98 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.57 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.46 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.18 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  43.43 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.96 
 
 		 404 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.28 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  43.43 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  40.98 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.54 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.43 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.51 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  43.88 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.51 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  42.43 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  44.19 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.98 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.63 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  44.78 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  46.75 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.64 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.9 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.6 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  41.64 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.4 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.13 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.66 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.41 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  41.37 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  38.42 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 		 392 aa  272  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4014  cystathionine gamma-synthase  40.32 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.7 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.02 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.21 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  44.38 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.08 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.79 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.92 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  41.92 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.48 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.03 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.32 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.69 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.69 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  44.08 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.53 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.58 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.53 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.45 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.69 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.69 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  42.31 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.84 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.77 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  43.53 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.99 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.57 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.42 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>