More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4014 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4014  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 400 aa  830    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  43.16 
 
 		 377 aa  299  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.62 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  41.64 
 
 		 378 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.7 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.38 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  41.29 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.83 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.33 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.05 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.34 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.38 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.26 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.12 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  38.58 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.58 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  38.54 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  39.21 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.18 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.1 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.62 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  40.32 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  38.85 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  38.77 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.12 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.29 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.83 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  38.98 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  41.05 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.98 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.85 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.04 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.2 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.95 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  37.87 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.04 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  38.74 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.75 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  39.5 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.01 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.84 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.89 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.93 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2427  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  37.5 
 
 		 457 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.363581  normal  0.253558 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.41 
 
 		 426 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  36.63 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.41 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2044  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.34 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.32 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1994  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.11 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.41 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2013  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.5 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  normal  0.048822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  35.85 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 		 390 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.97 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  41.03 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  38.61 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  37.47 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  38.67 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.67 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.97 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.7 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>