More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4838 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  96.92 
 
 		 389 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 389 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  97.43 
 
 		 389 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 		 391 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.8 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.13 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.42 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.15 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43.36 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.32 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.43 
 
 		 397 aa  292  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.89 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.96 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  42.08 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.46 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 413 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.4 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.09 
 
 		 403 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  40.53 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  43.43 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.4 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.13 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  42.73 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  42.53 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.57 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.43 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 		 393 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.54 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.38 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  44.48 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  41.14 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  43.88 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  43.4 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  46.45 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.16 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  43.92 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  45.07 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.84 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.84 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  39.24 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  43.65 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.9 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.9 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.13 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  43.49 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.66 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  44.2 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.13 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.41 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  43.24 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  41.64 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  44.38 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4014  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  43.09 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.09 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.38 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.21 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.92 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.86 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.79 
 
 		 397 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.84 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.86 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.28 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.27 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  42.99 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.48 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  42.99 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  44.38 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.43 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.79 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.42 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.19 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  42.4 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.18 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  42.14 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.52 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.18 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>