More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3306 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3306  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 391 aa  811    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  41.76 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.56 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1289  Cystathionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.985724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  40.62 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  38.86 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  37.43 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.77 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.72 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.24 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.66 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.66 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  35.44 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.75 
 
 		 452 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  37.79 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  40.22 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2286  cystathionine gamma-synthase  38.76 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1264  cystathionine gamma-synthase  37.97 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.3 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.34 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.98 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.69 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.3 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.69 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.69 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.6 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.7 
 
 		 403 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.44 
 
 		 406 aa  255  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.81 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.98 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.78 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.43 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  36.6 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.23 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.95 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.95 
 
 		 398 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  37.73 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.36 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.15 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.46 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.05 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  37.7 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 394 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  38.97 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  35.08 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.19 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.95 
 
 		 407 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.48 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.32 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.18 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.08 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.54 
 
 		 387 aa  249  9e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  37.95 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.9 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.56 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.1 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.5 
 
 		 397 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.21 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.31 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.82 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.16 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  37.31 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  38.96 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  39.51 
 
 		 389 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.53 
 
 		 403 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  39.24 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.84 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  35.05 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.66 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.94 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.13 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.01 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  37.9 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  33.94 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.02 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.4 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.07 
 
 		 395 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>