More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1981 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
400 aa  815    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.08 
 
 
388 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  45.65 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 
390 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  46.98 
 
 
378 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.11 
 
 
390 aa  342  8e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 
390 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.79 
 
 
397 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
378 aa  335  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 
386 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.92 
 
 
383 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 
377 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  43.8 
 
 
381 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.38 
 
 
394 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  43.09 
 
 
378 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 
392 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  42.63 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.74 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.84 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.3 
 
 
398 aa  327  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  46.19 
 
 
390 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 
394 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 
384 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  43.49 
 
 
394 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  41.93 
 
 
385 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  45.07 
 
 
377 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.86 
 
 
387 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  41.53 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 
387 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  44.94 
 
 
397 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 
381 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 
404 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 
404 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 
394 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 
389 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.65 
 
 
378 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  41.58 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  43.89 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  42.67 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  42.27 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 
426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
381 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  42.63 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  43.65 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.06 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  41.32 
 
 
380 aa  312  6.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  43.95 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  43.08 
 
 
397 aa  311  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  42.34 
 
 
392 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 
426 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  43.08 
 
 
397 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  42.42 
 
 
397 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  42.08 
 
 
392 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
381 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  42.34 
 
 
392 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.84 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  41.27 
 
 
379 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.82 
 
 
400 aa  308  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  42.25 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  42.74 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  42.08 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  42.34 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  42.02 
 
 
383 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.59 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  42.34 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  42.74 
 
 
377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.44 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  43.08 
 
 
380 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 
378 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  42.56 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  41.82 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  42.33 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  42.33 
 
 
382 aa  305  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 
391 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 
399 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  41.58 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  43.64 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  42.3 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.84 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.84 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  41.56 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  42.45 
 
 
397 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 
377 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 
377 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>