More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1995 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  78.41 
 
 		 404 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  100 
 
 		 403 aa  815    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  55.72 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  54.73 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  53.44 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  46.08 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  43.36 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  44.7 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.44 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  42 
 
 		 407 aa  291  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.56 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  43.3 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 378 aa  288  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41.28 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  43.19 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.52 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  42.14 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.43 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.65 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.5 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.51 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  41.12 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.5 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  41.65 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.25 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.9 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 376 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  40.3 
 
 		 413 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.07 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  41.01 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.32 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  40.9 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.25 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.31 
 
 		 392 aa  275  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  41.48 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.54 
 
 		 397 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  42.09 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  41.94 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  40.56 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.54 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.55 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3131  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.74 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.17 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.75 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.31 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.51 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.06 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  39.8 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.53 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.6 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.45 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.07 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  43.51 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  40.62 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.07 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.82 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.82 
 
 		 403 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.65 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  40.45 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>