More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2896 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
402 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  63.04 
 
 
403 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  57.74 
 
 
397 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  52.85 
 
 
404 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  53.44 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  41.26 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  42.7 
 
 
401 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 
396 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 
392 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.14 
 
 
385 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.1 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42.11 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.55 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 
393 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.15 
 
 
392 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 
377 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  40.06 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.6 
 
 
387 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  39.26 
 
 
378 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.91 
 
 
391 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.16 
 
 
403 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  43.48 
 
 
391 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.56 
 
 
377 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.77 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  41.57 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  35.5 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  41.33 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.48 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.44 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.44 
 
 
393 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.3 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  41.1 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.63 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.6 
 
 
388 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 
398 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 
397 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.62 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.42 
 
 
378 aa  242  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.56 
 
 
399 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.18 
 
 
393 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.2 
 
 
390 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  43.15 
 
 
390 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.46 
 
 
406 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 
372 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  39.42 
 
 
401 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.02 
 
 
403 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.35 
 
 
381 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 
394 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.45 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  43 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.25 
 
 
397 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  39.7 
 
 
393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.83 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.96 
 
 
398 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 
390 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 
426 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  35.07 
 
 
392 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  39.44 
 
 
400 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 
389 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  41.31 
 
 
399 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
418 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.57 
 
 
386 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36 
 
 
393 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  39.08 
 
 
394 aa  238  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 
377 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.52 
 
 
389 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.32 
 
 
434 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  38.89 
 
 
377 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  38.89 
 
 
377 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 
383 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.69 
 
 
390 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  36.23 
 
 
396 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  43.31 
 
 
387 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.82 
 
 
400 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.65 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.48 
 
 
397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.01 
 
 
422 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.2 
 
 
396 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  38.66 
 
 
378 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 
393 aa  235  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.59 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  40.44 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.24 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.87 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  39.78 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  38.61 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  38.61 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.72 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.71 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.6 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  38.61 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  38.42 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  42.65 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.11 
 
 
403 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 
390 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>