More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1913 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
390 aa  800    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  54.2 
 
 
376 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  55.01 
 
 
372 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  53.93 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  48.96 
 
 
392 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  47.57 
 
 
373 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  49.61 
 
 
387 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  48.03 
 
 
383 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 
379 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  48.24 
 
 
371 aa  359  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 
381 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  50.68 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  47.34 
 
 
383 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.72 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  47.75 
 
 
381 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 
389 aa  348  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  48.21 
 
 
387 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 
390 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 
388 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.24 
 
 
379 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 
385 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 
372 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  47.21 
 
 
381 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  48.22 
 
 
383 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
392 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
392 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
392 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 
377 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 
379 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  45.91 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  46.88 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  46.25 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  44.82 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 
401 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 
398 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.93 
 
 
402 aa  329  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 
379 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 
380 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.42 
 
 
378 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  49.19 
 
 
379 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  45.91 
 
 
380 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  45.03 
 
 
389 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 
379 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.24 
 
 
397 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  49.46 
 
 
379 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.95 
 
 
380 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.15 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  45.41 
 
 
384 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.41 
 
 
387 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.11 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 
394 aa  319  5e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  47.57 
 
 
390 aa  318  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.08 
 
 
386 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  42.26 
 
 
380 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  44.47 
 
 
380 aa  318  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
390 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 
381 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  42.59 
 
 
378 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.6 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  45.29 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  43.75 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  46.23 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  41.56 
 
 
385 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.42 
 
 
377 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 
388 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  42.59 
 
 
378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  44.39 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  43.08 
 
 
380 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  42.15 
 
 
386 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.13 
 
 
390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  40.52 
 
 
400 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  44.47 
 
 
381 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  43.23 
 
 
383 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 
390 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  44.36 
 
 
434 aa  299  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 
379 aa  299  6e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
378 aa  299  7e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  42.37 
 
 
394 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  43.38 
 
 
426 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  44.9 
 
 
413 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  40.84 
 
 
387 aa  295  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 
387 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  42.15 
 
 
382 aa  295  9e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.8 
 
 
383 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 
387 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 
387 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 
387 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.6 
 
 
394 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 
394 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  40.58 
 
 
387 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.22 
 
 
377 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  40.58 
 
 
387 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  40.58 
 
 
387 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.22 
 
 
377 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.6 
 
 
394 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>