More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3473 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  92.18 
 
 		 380 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 372 aa  756    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  63.61 
 
 		 376 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  59.41 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  56.72 
 
 		 371 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  55.01 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  59.3 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  55.23 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  58.22 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  53.49 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  53.74 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  56 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  53.48 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  54.96 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  53.7 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  53.6 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  53.07 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  53.44 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  53.17 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  52.27 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  53.74 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  51.73 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  51.7 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  51.34 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  50.66 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  51.47 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  54.82 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  52.12 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  56 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  50.66 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  53.74 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  52.12 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  52.12 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  52.12 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  50.67 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  50.83 
 
 		 387 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  51.46 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  47.87 
 
 		 379 aa  359  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  49.73 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.34 
 
 		 402 aa  358  9e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  56.06 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  47.37 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  50.83 
 
 		 383 aa  355  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  47.79 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  51.03 
 
 		 411 aa  353  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  52 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  53.07 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.97 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  52.27 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  46.44 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  48.41 
 
 		 392 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 381 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  47.89 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.91 
 
 		 387 aa  346  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  46.97 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  46.05 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  52.38 
 
 		 434 aa  343  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  52.49 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  49.08 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  48.67 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.35 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  52.32 
 
 		 413 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  45.53 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  52.82 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  46.61 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.86 
 
 		 380 aa  335  5.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  51.93 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  48.01 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  49.73 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 		 378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  45.79 
 
 		 383 aa  328  7e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  46.44 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  46.44 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  45.36 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.76 
 
 		 377 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.88 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  52.55 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  44.03 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  47.62 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  48.56 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  47.14 
 
 		 390 aa  319  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 		 393 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>