More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 401 aa  811    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  73.96 
 
 		 390 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  69.85 
 
 		 401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  46.08 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  43.47 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  43.11 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 		 399 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.81 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.25 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.76 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  42.7 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.98 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.98 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  37.18 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.53 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.7 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.36 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.54 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  41.43 
 
 		 377 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.54 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.6 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.64 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  40.76 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.28 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.65 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  40.98 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  42.45 
 
 		 389 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  43.57 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.54 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  41.43 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.68 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.01 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  40.92 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.13 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  41.48 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.34 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.86 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.48 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  39.39 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.32 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  40.46 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  40.83 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  40.15 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.26 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.44 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.04 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.83 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  40.98 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.56 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.07 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.91 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.23 
 
 		 393 aa  246  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.21 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.24 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.9 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.73 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.92 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.49 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.71 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.12 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.66 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.02 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  38.34 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  36.92 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.89 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.21 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>