More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1506 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 373 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  57.41 
 
 		 376 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  59.41 
 
 		 372 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  57.91 
 
 		 380 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  50.54 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  55.76 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  47.57 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  50.4 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  52.83 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 389 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 383 aa  358  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 389 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  47.87 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  47.73 
 
 		 377 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.47 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  49.73 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  48.62 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.26 
 
 		 378 aa  338  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  48.27 
 
 		 379 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  46.68 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.35 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  47.66 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  43.49 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  46.84 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  43.46 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 		 380 aa  325  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  45.97 
 
 		 393 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.47 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.04 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.77 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.27 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 		 426 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  47.21 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  47.07 
 
 		 383 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.21 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  45.93 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.77 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  42.74 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  46.34 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 		 426 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.22 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  43.27 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  47.84 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  42.11 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  46.58 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  47.21 
 
 		 406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  46.01 
 
 		 390 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.01 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  44.18 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.71 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  44.18 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  44.18 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  43.54 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  44 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.97 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.05 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 411 aa  301  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  45.79 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 		 377 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  46.78 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  42.22 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  46.76 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>