More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4330 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  86.81 
 
 		 379 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  66.22 
 
 		 386 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  63.61 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  65.68 
 
 		 386 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  63.33 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  61.8 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  62.2 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  56.68 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  51.08 
 
 		 376 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.74 
 
 		 377 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  52.82 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  49.46 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  53.44 
 
 		 378 aa  335  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  52.97 
 
 		 380 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  52.52 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  46.76 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  50.94 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.81 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  45.89 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  46.54 
 
 		 392 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  45.89 
 
 		 379 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  46.03 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  45.88 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  45.09 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  49.48 
 
 		 385 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  46.09 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  46.99 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  45.21 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  45.03 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  45.69 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.58 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  46.15 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  43.41 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  43.9 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  45.89 
 
 		 380 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  47.99 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.67 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.6 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  40.38 
 
 		 392 aa  275  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  45.81 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.5 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  41.14 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  44.07 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.16 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.69 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  47.43 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.66 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.66 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  46.21 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  40.81 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  39.45 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.05 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  44.02 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.14 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.89 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  43.51 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.42 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.59 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.14 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  45.12 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.08 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  43.68 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.02 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.36 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.11 
 
 		 402 aa  258  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  41.42 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.43 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.32 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.73 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>