More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0648 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  78.41 
 
 		 403 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 404 aa  822    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  55.22 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  55.9 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  52.85 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43 
 
 		 399 aa  328  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  42.56 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  43 
 
 		 392 aa  311  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  43.29 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.64 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 		 377 aa  292  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  43.11 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41.65 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.42 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  40.93 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.22 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  43 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.51 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  43.29 
 
 		 386 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  41.23 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  41.84 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  42.93 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 392 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.32 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.28 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  39.56 
 
 		 401 aa  276  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 383 aa  276  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  44.95 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.34 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.34 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  41.01 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.59 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  41.77 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.6 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.7 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  41.77 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.59 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.72 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.65 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  42.43 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.42 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.38 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.62 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.65 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.62 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.65 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  39.03 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.99 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.19 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  39.35 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.4 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  39.7 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.79 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.65 
 
 		 426 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 380 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.42 
 
 		 441 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 377 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 377 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  37.97 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  39.55 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  40.92 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.25 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  40.5 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.9 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.59 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.44 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>