More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0992 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 427 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  890    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  99.77 
 
 		 433 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 		 427 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  890    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  96.53 
 
 		 433 aa  862    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 433 aa  888    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  57.18 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  59.65 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.08 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  56.91 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  57.49 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  50.24 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  47.47 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  48.47 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  46.52 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  45.69 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  48 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  44.07 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.82 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.22 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 398 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.83 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  35.34 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.63 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  36.99 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  35.34 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.1 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  35.34 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  35.87 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  34.92 
 
 		 391 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  35.29 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  34.84 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  34.68 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  34.44 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  36.75 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.75 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  34.68 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  34.68 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.39 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.9 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.26 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.5 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.76 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  36.62 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 392 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.56 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.32 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.74 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.98 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.95 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.48 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.32 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  36.41 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.59 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.08 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.59 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.64 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.24 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  37.15 
 
 		 386 aa  226  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  37.15 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  32.82 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  37.4 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.75 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  37.15 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  37.15 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.5 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.24 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  34.9 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  35.79 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.55 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  33.5 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  35.01 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.82 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  37.37 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  32.48 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.82 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  36.87 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  36.87 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  37.37 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  34.52 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  36.87 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  35.31 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  36.87 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>