More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2201 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  80.58 
 
 		 427 aa  714    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 427 aa  868    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  75 
 
 		 427 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  80.66 
 
 		 427 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  83.8 
 
 		 427 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  83.73 
 
 		 427 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  68.88 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  68.88 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  68.91 
 
 		 375 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  67.57 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  57.04 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  55.42 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  55.66 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  55.42 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  56.12 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  53.54 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  53.44 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  53.59 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  52.68 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  51.44 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  51.44 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  48.65 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  36.23 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  36.23 
 
 		 392 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  36.01 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.14 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  39.42 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40.14 
 
 		 398 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.99 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  36.5 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.19 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.59 
 
 		 378 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  35.45 
 
 		 379 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.04 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  36.09 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  35.37 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.87 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.62 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.28 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  36.03 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  37.28 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  36.17 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.21 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  34.97 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.77 
 
 		 392 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  36.17 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  37.12 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  35.45 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  34.22 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.12 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  38.44 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  36.76 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  34.9 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.18 
 
 		 390 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.07 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.62 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.92 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  36.04 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  32.35 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  35.34 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  34.15 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.9 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.73 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  39.27 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2972  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.4 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  35.63 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  35.61 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3089  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.15 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 		 426 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>