More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0483 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 430 aa  873    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  73.66 
 
 		 439 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  53.35 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  54.87 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  52.68 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  52.1 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  52.1 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.58 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  52.35 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  51.99 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  50.11 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  52.26 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  52.29 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  50.12 
 
 		 424 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  49.64 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  47.93 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  49.41 
 
 		 422 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  49.41 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  46.59 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  47.53 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  44.42 
 
 		 416 aa  348  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.96 
 
 		 375 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.89 
 
 		 391 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  36.89 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  36.65 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.15 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.04 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  38.05 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  36.52 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.86 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  36.87 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.1 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.28 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  36.18 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  35.9 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.04 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.27 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  35.26 
 
 		 394 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.61 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  36.21 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  37.22 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 378 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  34.31 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  36.63 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  36.47 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  38.26 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.18 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.28 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.04 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  35.89 
 
 		 390 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  34.77 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  37.16 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.79 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  34.33 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  35.86 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  34.75 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  34.26 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.53 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.19 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.63 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.33 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  34.26 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.24 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.77 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  34.85 
 
 		 377 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  34.91 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  34.76 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  34.94 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  36.14 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>