More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1965 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  82.67 
 
 		 427 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 427 aa  867    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  92.27 
 
 		 427 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  74.24 
 
 		 427 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  80.42 
 
 		 427 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  81.5 
 
 		 427 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  68.24 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  67.53 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  66.18 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  65.67 
 
 		 375 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  57.98 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  59.61 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  55.95 
 
 		 427 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  56.43 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  59.37 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  55.94 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  55.79 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  55.58 
 
 		 430 aa  454  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  51.42 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  51.53 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  52.06 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  50.24 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  49.76 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  39.12 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.57 
 
 		 396 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.63 
 
 		 397 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 391 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  38.88 
 
 		 391 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.34 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.9 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.4 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.97 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  36.1 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.71 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.65 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  34.8 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.06 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  36.61 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.86 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  37.23 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.86 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.35 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  35.19 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  35.29 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.2 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.96 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.17 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  35.48 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.25 
 
 		 379 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.96 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.94 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.96 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.43 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.9 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  35.96 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.11 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.11 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.43 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.14 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  35.61 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  35.61 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  35.61 
 
 		 377 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  36.2 
 
 		 395 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2528  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.04 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.18 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  35.35 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  35.04 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.25 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.87 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  35.35 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  37.86 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.19 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  35.62 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.07 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  35.96 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  35.1 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  35.52 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  37.62 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  33.42 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>