More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1177 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 428 aa  874    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  70.19 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  69.95 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  71.39 
 
 		 422 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  52.4 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  52.88 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  51.06 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  53.05 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  51.2 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.53 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  52.53 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  51.05 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  51.52 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  51.92 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  50.11 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  52.1 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  49.29 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  49.17 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  46.06 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  46.06 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  45.34 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  45.3 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.86 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  41.85 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  44.67 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 392 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.36 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  41.84 
 
 		 392 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  41.36 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.48 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  41.36 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  41.36 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  41.83 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  42.61 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  41.87 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.38 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  41.73 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.38 
 
 		 398 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.39 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 392 aa  292  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.45 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.53 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.35 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  41.12 
 
 		 413 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  42.89 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.4 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  41.52 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.98 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.38 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 386 aa  265  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.56 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.47 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.13 
 
 		 379 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  36.54 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.5 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.83 
 
 		 406 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.74 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.55 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  38.12 
 
 		 379 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  38.35 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.26 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.54 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  39.32 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  39.2 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.43 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.16 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.92 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.97 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.28 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.28 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>