More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1017 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  74.71 
 
 
427 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  92.33 
 
 
427 aa  796    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  81.97 
 
 
427 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  80.66 
 
 
427 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  100 
 
 
427 aa  875    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  83.37 
 
 
427 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  66.82 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  66.35 
 
 
429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  65.94 
 
 
429 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  66.17 
 
 
375 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  56.19 
 
 
427 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  55.71 
 
 
427 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  56.71 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  56.47 
 
 
433 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  55.95 
 
 
428 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  54.37 
 
 
439 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  53.35 
 
 
430 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  51.65 
 
 
424 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  50.94 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  50.6 
 
 
422 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  49.51 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  38.05 
 
 
391 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.8 
 
 
391 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
392 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
392 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
392 aa  279  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.32 
 
 
392 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.32 
 
 
392 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40.68 
 
 
398 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
391 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
391 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.68 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.07 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 
398 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.69 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  36.83 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40 
 
 
397 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 
396 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 
394 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  37.96 
 
 
382 aa  260  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.18 
 
 
418 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.27 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.52 
 
 
397 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36.52 
 
 
397 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.52 
 
 
397 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  34.4 
 
 
400 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 
392 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 
393 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.03 
 
 
397 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  36.36 
 
 
379 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  36.61 
 
 
386 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.5 
 
 
379 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.83 
 
 
386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.83 
 
 
386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  36.45 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.86 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  36.03 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.01 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 
392 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  36.71 
 
 
395 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.27 
 
 
397 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.17 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.77 
 
 
392 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.27 
 
 
449 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.6 
 
 
388 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.86 
 
 
426 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.86 
 
 
383 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.57 
 
 
426 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.38 
 
 
397 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4968  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.36 
 
 
470 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35.66 
 
 
386 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2528  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.18 
 
 
425 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.24 
 
 
425 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  34.56 
 
 
379 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.19 
 
 
378 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.65 
 
 
390 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.79 
 
 
390 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 
378 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  34.72 
 
 
388 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  36.07 
 
 
380 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  35.22 
 
 
397 aa  236  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  35.97 
 
 
392 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.11 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.88 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.11 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3191  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.02 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  38.23 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.9 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  34.15 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.62 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.65 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>