More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3672 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  75.47 
 
 		 422 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 424 aa  865    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  91.98 
 
 		 424 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  70.19 
 
 		 428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  53.32 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  51.65 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  53.25 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  51.44 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  50.84 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  49.64 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  52.55 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  50.59 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  49.16 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  50.35 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  50.59 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  50.12 
 
 		 430 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  46.14 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  46.97 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  46.38 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  45.87 
 
 		 416 aa  349  6e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  45.18 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  41.98 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.77 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  42.29 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.52 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  43.28 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  41.48 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  41.73 
 
 		 396 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.25 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 392 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  39.71 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.29 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 		 401 aa  280  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  39.47 
 
 		 392 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 392 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  39.47 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  39.47 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 		 392 aa  275  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.79 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.7 
 
 		 378 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  40.3 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 392 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  40.3 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  40.3 
 
 		 386 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.71 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.24 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.55 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.74 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  40.86 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.05 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 397 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 388 aa  259  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.43 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.19 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.88 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.34 
 
 		 397 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.14 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.77 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  38.58 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  36.5 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.06 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  38.83 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  38.58 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.06 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.32 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.8 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.61 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  38.32 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  38.32 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>