More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3503 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  73.86 
 
 		 427 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 427 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  74.94 
 
 		 427 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  75.41 
 
 		 427 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  75 
 
 		 427 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  74.71 
 
 		 427 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  68.94 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  68 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  68.12 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  62.19 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  56.07 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  57.38 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  55.5 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  56.07 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  55.48 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  52.26 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  52.46 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  50.59 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  50.35 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  51.92 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  50.36 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  49.27 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 392 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  37.59 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.71 
 
 		 391 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.98 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.23 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.93 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.79 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.01 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.78 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.82 
 
 		 394 aa  259  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  36.27 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.06 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.35 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.52 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  35.87 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.23 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  35.21 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.75 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  35.63 
 
 		 379 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  34.8 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.12 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  33.16 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.87 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.69 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.83 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2528  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.75 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.52 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.55 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3191  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.53 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.38 
 
 		 386 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.55 
 
 		 426 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  36.61 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.92 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  36.46 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.9 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.52 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.19 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.68 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.72 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.48 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4968  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.77 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3089  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.38 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.71 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.92 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.24 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.46 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.23 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.13 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 377 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  35.68 
 
 		 392 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 377 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0028  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.22 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558069  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 377 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  35.79 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>