More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0856 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 439 aa  888    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  73.66 
 
 		 430 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  54.37 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  55.56 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  52.48 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  52.72 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  53.54 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  55.66 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.22 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  52.26 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  51.8 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  53.83 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  50.35 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  51.8 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  50.12 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  49.17 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  48.56 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  48.08 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  48.21 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  46.06 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.91 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.25 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.25 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 		 392 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  38.33 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  38.33 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.18 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.8 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.9 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.91 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  36.15 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.11 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.02 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  37.65 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.59 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  35.46 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  36.64 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 397 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  38.92 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.41 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.61 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.91 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.33 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  35.44 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.18 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.34 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  38.05 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  33.99 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  34.56 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  33.98 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.71 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  36.54 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  35.42 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  37.41 
 
 		 393 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.98 
 
 		 392 aa  227  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  37.05 
 
 		 393 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  34.79 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.77 
 
 		 404 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.77 
 
 		 404 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 397 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.64 
 
 		 397 aa  226  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.08 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.87 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  36.11 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  34.96 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  38.06 
 
 		 394 aa  223  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 		 397 aa  223  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  36.79 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  35.94 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.43 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.41 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.01 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 		 391 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>