More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2070 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
416 aa  823    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  49.51 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  49.27 
 
 
427 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  48.78 
 
 
427 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  51.2 
 
 
429 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  49.25 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  48.65 
 
 
427 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.72 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  49.27 
 
 
427 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  48.23 
 
 
429 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  46.06 
 
 
439 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  46.32 
 
 
424 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  45.34 
 
 
428 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 
427 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  45.87 
 
 
424 aa  349  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  44.42 
 
 
430 aa  348  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  43.83 
 
 
433 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  44.31 
 
 
433 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  45.26 
 
 
427 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  44.47 
 
 
428 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  44.23 
 
 
422 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.95 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.99 
 
 
394 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  35.82 
 
 
391 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  35.82 
 
 
392 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.06 
 
 
391 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 
386 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  36.8 
 
 
394 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.58 
 
 
392 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  35.58 
 
 
392 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.54 
 
 
398 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  36.23 
 
 
392 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  38.88 
 
 
383 aa  255  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.9 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  35.51 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.05 
 
 
398 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  35.58 
 
 
391 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  35.58 
 
 
391 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 
386 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  35.34 
 
 
392 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  35.1 
 
 
392 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.84 
 
 
390 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 
399 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.95 
 
 
397 aa  249  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  38.26 
 
 
418 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  34.62 
 
 
392 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  40.58 
 
 
390 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 
400 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.83 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.54 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  40.72 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.76 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  36.97 
 
 
380 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  38.93 
 
 
378 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  40.48 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  37.56 
 
 
379 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.78 
 
 
389 aa  243  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.91 
 
 
377 aa  243  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.17 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  36.83 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 
404 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 
392 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.5 
 
 
404 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.25 
 
 
392 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  37.56 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
377 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
377 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
377 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
377 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  37.14 
 
 
379 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
377 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
377 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.65 
 
 
399 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  38.24 
 
 
378 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.56 
 
 
385 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
377 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.92 
 
 
379 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.17 
 
 
388 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
377 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 
386 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  39.22 
 
 
399 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.9 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  37.13 
 
 
380 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  37.29 
 
 
398 aa  235  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.71 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.37 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.34 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.46 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.04 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>