More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0621 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  100 
 
 
422 aa  866    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  76.65 
 
 
424 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  75.47 
 
 
424 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  71.39 
 
 
428 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  53.44 
 
 
427 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  50.6 
 
 
427 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  50.93 
 
 
427 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.53 
 
 
429 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  50.95 
 
 
427 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  51.11 
 
 
427 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 
439 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  53.1 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  51.33 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  50.95 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  50.36 
 
 
427 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  49.41 
 
 
430 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  50.36 
 
 
427 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  49.52 
 
 
427 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  47.71 
 
 
433 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  47.47 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  47.23 
 
 
433 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  45.57 
 
 
375 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  44.23 
 
 
416 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  41.65 
 
 
398 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  41.19 
 
 
396 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  43.22 
 
 
396 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  41.46 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.65 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.65 
 
 
398 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.7 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
392 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  45.27 
 
 
400 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.27 
 
 
392 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.77 
 
 
392 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
392 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  40.82 
 
 
394 aa  279  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 
394 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  43.61 
 
 
386 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
391 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 
391 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
391 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  41.4 
 
 
399 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 
401 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  39.27 
 
 
391 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 
392 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 
392 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 
392 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 
393 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  43.11 
 
 
386 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  43.11 
 
 
386 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  42.01 
 
 
397 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.36 
 
 
408 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.97 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  41.49 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  41.75 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  41.49 
 
 
397 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.1 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  43.11 
 
 
390 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 
378 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  38.35 
 
 
393 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  42.01 
 
 
397 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.76 
 
 
392 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.74 
 
 
406 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.41 
 
 
378 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.91 
 
 
383 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.05 
 
 
402 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  42.28 
 
 
386 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  37.34 
 
 
388 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  39.63 
 
 
401 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.84 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  38.65 
 
 
413 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  41.07 
 
 
397 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.71 
 
 
396 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  40.77 
 
 
377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  40.77 
 
 
377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.51 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  38.33 
 
 
418 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.28 
 
 
377 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 
377 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.77 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.15 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.96 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.39 
 
 
386 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.48 
 
 
403 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  39.76 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.28 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  41.03 
 
 
391 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>