More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3235 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  85.75 
 
 		 429 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  87.15 
 
 		 429 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 429 aa  864    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  68.18 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  67.46 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  66.35 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  67.46 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  68.47 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  66.03 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  57.04 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  57.75 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  59.4 
 
 		 375 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  57.04 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  53.32 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  52.61 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  53.81 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  53.38 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  53.19 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  52.82 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  52.16 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.56 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  35.11 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  38.4 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  38.65 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  38.65 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 		 400 aa  246  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  38.14 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.53 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.02 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  35.29 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  35.35 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  35.35 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.35 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.56 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  36.7 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  34.87 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  34.87 
 
 		 392 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  34.62 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.56 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  35.11 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  35.11 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  34.87 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.32 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.63 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  36.06 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.34 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  35.28 
 
 		 378 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  35.35 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.08 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  35.06 
 
 		 379 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  39.26 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.09 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.09 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.09 
 
 		 377 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  34.49 
 
 		 394 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  37.09 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  35.84 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.09 
 
 		 377 aa  226  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  34.26 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  32.82 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  33.5 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  32.42 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  33.58 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  35.77 
 
 		 393 aa  223  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  37.01 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  36.29 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  35.18 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  34.95 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  33.58 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.09 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.09 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  31.75 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.02 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.84 
 
 		 397 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.55 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  33.83 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.77 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.87 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.57 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  34.84 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.1 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  36.69 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>