More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5459 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 429 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  87.44 
 
 		 429 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  91.61 
 
 		 429 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  69.62 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  68.9 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  68.88 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  68.18 
 
 		 427 aa  584  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  66.82 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  68.94 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  58.55 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  59.4 
 
 		 375 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  57.61 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  58.08 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  57.85 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  55.79 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  53.32 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  54.22 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  53.55 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  52.53 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  52.58 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  52.53 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  50.72 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  35.11 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.32 
 
 		 418 aa  253  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  34.87 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.23 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.77 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  34.62 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.77 
 
 		 398 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  34.38 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  38 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.71 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  34.14 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  34.14 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  33.9 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  34.14 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  34.38 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  34.38 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.94 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.59 
 
 		 396 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  33.9 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  35.35 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  35.92 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  33.49 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.02 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  33.58 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  34.49 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  32.58 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.33 
 
 		 390 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.86 
 
 		 401 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  34.81 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  39.42 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  34.01 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.15 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  33.75 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  35.51 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  32.17 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  33.33 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  38.69 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  33.41 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  34.41 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  36.36 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  37.06 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  36.61 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  36.45 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4276  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.79 
 
 		 423 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0324  Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme superfamily protein  34.25 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00819795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  33.17 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  35.52 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  32.04 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  34.84 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4968  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.53 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.9 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  34.84 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.12 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  37.35 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3089  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.44 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  34.59 
 
 		 377 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  38.44 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  34.84 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0028  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.79 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558069  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  34.59 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.62 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.25 
 
 		 397 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.74 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.38 
 
 		 386 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.34 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.2 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  34.59 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>