More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1875 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 375 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  68.91 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  69.15 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  68.91 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  66.17 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  65.67 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  62.19 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.4 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  58.65 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  59.4 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  47.15 
 
 		 428 aa  355  8.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  48.25 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  48 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  46.75 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  45.3 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  45.57 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  44.91 
 
 		 439 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  45.18 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  44.96 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  43.4 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 416 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  32.72 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  31.28 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  31.25 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  31.77 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  31.77 
 
 		 392 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  31.03 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  30.77 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  31.03 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  31.25 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  31.28 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  31.28 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  32.65 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  32.05 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  31.71 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  32.05 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  32.31 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  33.68 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  30.43 
 
 		 400 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.46 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  31.18 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  29.38 
 
 		 394 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  31.02 
 
 		 399 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  30.71 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  31.45 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  29.92 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  31.71 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  31.39 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.07 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  30.52 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.89 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  29.65 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  31.17 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  31.95 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  29.41 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  27.37 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.75 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  29.61 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.67 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.67 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  30.57 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.12 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.82 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  29.12 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.39 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.84 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.75 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.87 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  28.95 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.31 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.81 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.81 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  29.38 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  30.95 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  30.45 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.74 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  29.38 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  31.55 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1743  putative cystathionine gamma-synthase  29.33 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  30.1 
 
 		 392 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.1 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  28.25 
 
 		 386 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  31.95 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  30.64 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  31.17 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  28.1 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  30.63 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  30.62 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  26.42 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  31.17 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.42 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  30.81 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  29.08 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>