More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 393 aa  766    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3943  cystathionine gamma-synthase  66.75 
 
 		 382 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5539  Cystathionine gamma-synthase  62.99 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.904525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2849  cystathionine gamma-synthase  63.71 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8098  Cystathionine gamma-synthase  56.52 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.91 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  39.55 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.76 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.65 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  38.85 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  36.9 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.24 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.64 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.44 
 
 		 400 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.54 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.68 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  38.48 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.52 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.48 
 
 		 397 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 413 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.03 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  38.58 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.13 
 
 		 401 aa  232  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.25 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.94 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  40.23 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.39 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37.25 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.26 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.42 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.03 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  37.9 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.76 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.86 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  37.87 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.84 
 
 		 378 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  36.25 
 
 		 427 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  36.32 
 
 		 427 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  40.3 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 427 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.23 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.42 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.86 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  36.64 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  36.48 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  36.32 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.53 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  37.24 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.7 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  35.81 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  35.81 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  37.23 
 
 		 427 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.6 
 
 		 397 aa  219  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.45 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.45 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.94 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  38.78 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  35.81 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  42.21 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  35.26 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  39.48 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>