More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4740 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  81.77 
 
 		 427 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  81.97 
 
 		 427 aa  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 427 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  83.73 
 
 		 427 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  75.41 
 
 		 427 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  95.08 
 
 		 427 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  68.9 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  69.38 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  69.15 
 
 		 375 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  67.32 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  56.24 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  56 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  56.43 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  52.72 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  52.88 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  52.1 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  50.95 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  49.16 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  49.27 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.05 
 
 		 391 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 392 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.05 
 
 		 392 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.29 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 396 aa  279  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 392 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 		 391 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.32 
 
 		 392 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.71 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.47 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.47 
 
 		 398 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.32 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  39.27 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.96 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.56 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.14 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.19 
 
 		 379 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 		 400 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 386 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  37.32 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.1 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.43 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35.01 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.14 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  34.47 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  36.74 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  35.57 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.96 
 
 		 393 aa  236  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  36.89 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.25 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.78 
 
 		 390 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.28 
 
 		 380 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  34.31 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  34.23 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  34.18 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  38.13 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  33.82 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  36.47 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  34.23 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.98 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.33 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  37.65 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  35.12 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.26 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  35.42 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  32.84 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.16 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  33.74 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  35.7 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2528  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.16 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  35.44 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  33.82 
 
 		 397 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0324  Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme superfamily protein  36.55 
 
 		 380 aa  227  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00819795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  37.43 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  35.51 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  35.61 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  33.98 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4968  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.57 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>