161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  100 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  75 
 
 
152 aa  243  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.08 
 
 
163 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  54.05 
 
 
156 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  48.99 
 
 
156 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.66 
 
 
155 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  48.99 
 
 
158 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  40.54 
 
 
156 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  34.46 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.09 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.62 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
254 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
225 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  27.66 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.27 
 
 
225 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.97 
 
 
171 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  29.63 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
215 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
215 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  28.03 
 
 
1048 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1579  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.07 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  23.97 
 
 
245 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.72 
 
 
224 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
226 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.9 
 
 
220 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
228 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.59 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  36.71 
 
 
731 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.61 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.92 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  30.71 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
242 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  25.45 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.37 
 
 
226 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
241 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
224 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  22.97 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.21 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
230 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.61 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.52 
 
 
226 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
357 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2668  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0967754  hitchhiker  0.000000348595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  25.56 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
252 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.59 
 
 
225 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
224 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.51 
 
 
237 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  27.97 
 
 
235 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
229 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
227 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 
224 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1179  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
213 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 
470 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  28 
 
 
322 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
248 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 
236 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
230 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
234 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.12 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.84 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>