57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0916 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  100 
 
 		 152 aa  309  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  33.33 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.78 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  29.63 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  27.27 
 
 		 738 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  28.06 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 412 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.56 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 408 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  24.06 
 
 		 419 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 170 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 562 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 562 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 221 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 562 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.01 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  26.55 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  23.26 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  22.39 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 248 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.14 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  21.31 
 
 		 245 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>