97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1182 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  60.39 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.22 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  34.46 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  41.96 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  34.01 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  32.87 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.66 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  23.81 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.19 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  27.97 
 
 		 747 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 		 237 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 563 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3745  cyclic nucleotide-binding protein  25.87 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0517034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25 
 
 		 225 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  22.06 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 622 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  21.74 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  24.44 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1292  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  27.27 
 
 		 620 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  21.88 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  21.77 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  29.91 
 
 		 734 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 246 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 253 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  26.72 
 
 		 738 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  24.8 
 
 		 749 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  22.73 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  22.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  22.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.73 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  18.38 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  23.44 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  20.9 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  25.69 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 222 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  21.74 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  24.55 
 
 		 251 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 224 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 254 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 228 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  28 
 
 		 1048 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  31.96 
 
 		 472 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3341  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  23.94 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  24.31 
 
 		 153 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  21.48 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  22.83 
 
 		 407 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  22.96 
 
 		 245 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.83 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.03 
 
 		 570 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 240 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.71 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  23.02 
 
 		 1085 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  22.73 
 
 		 232 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2689  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 		 246 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  26.36 
 
 		 381 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  24.29 
 
 		 286 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 232 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 227 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  22.73 
 
 		 232 aa  40.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  24.56 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>