207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3652 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
153 aa  306  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.14 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.41 
 
 
163 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  37.86 
 
 
152 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  36.23 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  36.62 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.41 
 
 
155 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  30.66 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  32.59 
 
 
747 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.79 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
224 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 
239 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 
219 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
219 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
249 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.19 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  29.13 
 
 
245 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.33 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.55 
 
 
226 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
241 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
230 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 
239 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  27.69 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 
227 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.66 
 
 
228 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 
151 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
229 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
236 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 
236 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
228 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
229 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.71 
 
 
226 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
236 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
237 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.99 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 
228 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.74 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
228 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  23.29 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  27.14 
 
 
495 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 
225 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  25.47 
 
 
230 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.47 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
601 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  30.99 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.72 
 
 
231 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
240 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 
231 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  25 
 
 
242 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.28 
 
 
225 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.21 
 
 
225 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
228 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
413 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
224 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  28.74 
 
 
225 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 
153 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
234 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
226 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
261 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.95 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  31 
 
 
528 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
230 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 
153 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
561 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.06 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  28.97 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2668  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0967754  hitchhiker  0.000000348595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>