82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1505 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  60.39 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  37.75 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  46.21 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.51 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  40.54 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  38.41 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3745  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0517034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.72 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  28.78 
 
 		 409 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 412 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  28.23 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  24.5 
 
 		 226 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.55 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.81 
 
 		 227 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  33.98 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  25.53 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  24.78 
 
 		 1085 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  28.67 
 
 		 620 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 801 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.03 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.87 
 
 		 1018 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  26.15 
 
 		 254 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 241 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 249 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 507 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  22.52 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.83 
 
 		 419 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 409 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  23.81 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  21.28 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 948 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4069  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.46 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 		 286 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  22.39 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.26 
 
 		 1018 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 563 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 226 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.9 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  28.7 
 
 		 734 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>