55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3434 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  47.86 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.08 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.14 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  37.59 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  37.09 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  38.73 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  25.33 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.77 
 
 		 225 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  25.18 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  21.49 
 
 		 267 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.98 
 
 		 226 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  21.05 
 
 		 739 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  24.46 
 
 		 601 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  21.48 
 
 		 230 aa  44.7  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  22.97 
 
 		 747 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.24 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1280  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 223 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 242 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.15 
 
 		 225 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  25.58 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0447  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.88 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0270  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.88 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.479827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  28.35 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 239 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4199  cyclic nucleotide-binding protein  20.87 
 
 		 260 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  25.89 
 
 		 731 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  22.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 239 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.9 
 
 		 603 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.9 
 
 		 603 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>