More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2005 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
153 aa  300  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  99.35 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  88.59 
 
 
152 aa  268  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  59.06 
 
 
151 aa  166  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  48.34 
 
 
151 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  42.45 
 
 
151 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  42.25 
 
 
151 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 
151 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  43.44 
 
 
150 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  35.53 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  36.6 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.8 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.48 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  34.87 
 
 
194 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  39.86 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  35.76 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  37.09 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
148 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.28 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  32.56 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.82 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.62 
 
 
219 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  31.2 
 
 
230 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  32.09 
 
 
410 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  31.9 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 
237 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  31.75 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.84 
 
 
226 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.38 
 
 
561 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  33.82 
 
 
749 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  30.77 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 
503 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 
570 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  34.58 
 
 
729 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  32.81 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 
225 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.27 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
242 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  28.8 
 
 
739 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1632  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
250 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.68 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.83 
 
 
225 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.37 
 
 
224 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
226 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
413 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  29.63 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 
419 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
252 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  25.89 
 
 
1408 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.37 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.48 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
1043 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 
584 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
224 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  27.21 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.84 
 
 
129 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
224 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  33 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  32.69 
 
 
426 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>