More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1632 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1632  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  63.76 
 
 
228 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4410  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.87 
 
 
225 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.994375  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0065  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
258 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0605636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  56.22 
 
 
251 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  48.33 
 
 
235 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
228 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.18 
 
 
221 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.83 
 
 
221 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  50.23 
 
 
228 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4082  cyclic nucleotide-binding  46.33 
 
 
220 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
220 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.79 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.49 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.68 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  32.39 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.14 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  28.57 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.11 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.98 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.55 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  27.96 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.51 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.89 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.84 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.11 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.34 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  30.05 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.16 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
354 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.18 
 
 
219 aa  72  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.32 
 
 
222 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.43 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.47 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.51 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.34 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  25.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  24.32 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>