More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2591 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 
224 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  33.9 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.68 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.99 
 
 
236 aa  94.7  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  32.32 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.75 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.99 
 
 
226 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.69 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.7 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  31.72 
 
 
239 aa  87  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4410  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.994375  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.56 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.87 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0065  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0605636  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.24 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.1 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.12 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.35 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.71 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.9 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  34.66 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  32.12 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.17 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.52 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  30.23 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.06 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.94 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  32.14 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.82 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.3 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  27.92 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  29.95 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  28.34 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  28.34 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30.37 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.53 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.77 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  28.88 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  29.95 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>